W tej sekcji opisano sposób definiowana preferencji programu MIB Manager, które są używane do wyszukiwania plików MIB.
Aby ustawić preferencje wyszukiwania, należy kliknąć opcję 
Preferencje lub wybrać z menu głównego opcję , a następnie z panelu po lewej stronie okna Preferencje kliknąć opcję Wyszukiwanie.
W polu Ścieżka wyszukiwania MIB należy ustawić ścieżkę wyszukiwania do katalogu, w którym znajdują się pliki MIB. Katalogi muszą być oddzielone średnikami (;). Wszystkie podkatalogi są przeszukiwane automatycznie w celu znalezienia zależnych plików MIB.
Domyślna ścieżka zawiera położenie podstawowych plików MIB oraz plików MIB RFC, które są dostępne z programem MIB Manager. Nowe katalogi można podać na końcu domyślnej ścieżki pliku. Zapewnia to, że podstawowy katalog jest wstępnie przeszukiwany w celu znalezienia zależności zawierających najczęściej używane bazy MIB, a następnie jest przeszukiwany katalog rfc, aby znaleźć mniej używane bazy MIB.